차라투 블로그

ADaM in CDISC and tidyCDISC

R
Rpackage
Shiny

Analysis Data Model in CDISC, tidyCDISC 오픈소스 프로그램에 대해서 알아보자
2023/05/02
Seoyoon Kim

sunburstr 패키지 소개

R
Rpackage

sunburstr 패키지의 이용한 계층적 데이터 표시 방법에 대해 알아보자
2023/04/21
Seoyoon Kim

pkgdown을 활용한 R 패키지 문서화

R
Rpackage
pkgdown
githubpage
documentation
website

R 패키지를 다른 사람들도 잘 활용할 수 있게 설명해주는 웹사이트를 pkgdown을 사용하여 만들어보자
2023/03/17
Jinhwan Kim

Python을 이용한 검색포털 API 활용

python
API

python을 이용한 크롤링 검색결과 저장하기
2023/02/15
Won Kim

shiny.likert 패키지 소개

R
Rpackage
shiny
plotly
shinyapps
likert
datavis
nocode

likert 패키지를 사용하는 shiny apps 개발/ 배포 과정
2023/02/15
Jinhwan Kim

Python과 Slack API를 이용한 대나무숲 앱 제작

python
streamlit

Slack API를 이용하여 Python 기반 대나무숲 앱 만들기
2023/02/07
Changwoo Lim

likert 패키지 소개

R
Rpackage
shiny
plotly
quarto

문항별 만족/불만족을 한번에 표현하는 likert chart를 그려보자
2023/02/05
Jinhwan Kim

Python Streamlit 패키지를 이용한 대시보드 만들기

python
streamlit

streamlit 패키지의 사용방법을 알아보자
2023/02/01
Kim Won

의료데이터분석가 성장기

presentation
R

의료데이터분석가 성장기를 다시 정리했습니다. 본 내용은 보건산업진흥원이 지원하고 성균관대학교 의과대학에서 주관하는 “융합형 의사과학자 심포지엄” 에서 발표 예정입니다.
2022/10/17
Jinseob Kim

GAM(Generalized Additive Model) 소개

presentation
lecture

비선형모델인 GAM(Generalized Additive Model) 을 소개합니다. 본 강의는 성균관대 바이오헬스 규제과학과 강의자료로 쓰일 예정입니다.
2022/09/30
Jinseob Kim

Shiny for Python

python
shiny

Python으로 반응형 웹 어플리케이션을 만들수 있는 Shiny for Python에 대해 소개합니다.
2022/08/19
Chaehee Lee

collapse 패키지 소개

R
collapse
data.table

collapse 패키지를 소개하고 data.table 패키지와 비교하여 파악해보겠습니다.
2022/07/25
beomsu Park

data.table 패키지 기초

R
data.table
lecture

데이터를 빠르게 가공할 수 있는 data.table에 대하여 패키지 설치부터, 기본 구조 및 데이터를 가공하여 재구조화 하는 방법에 대해서 소개합니다.
2022/07/13
KO JUN HYUK

데이터과학자가 갖춰야할 기술

presentation
R
statistics

의료분야 데이터과학자에 필요한 역량을 정리하였습니다. 본 내용은 성균관대학교 바이오헬스규제과학과 단기 교육 프로그램에서 발표할 예정입니다.
2022/06/27
Jinseob Kim

22년 지원사업 후기

presentation
kstartup

22년 각종 지원사업 선정, 탈락 후기를 공유합니다.
2022/04/12
Jinseob Kim

R로 논문용 그래프 그리기

R
Rpackage

R 기본 함수, ggplot2 패키지, ggpubr 패키지를 활용해 의학논문에 필요한 그래프를 만들어보자.
2022/03/25
Yumin Kim

Reviewer들을 위한 의학통계

presentation
lecture

제18차 대한이식학회 춘계학술대회 심포지엄에서 “리뷰어들을 위한 의학통계” 로 발표할 슬라이드를 미리 공유합니다.
2022/03/19
Jinseob Kim

data.table 패키지 소개

R
Rpackage

대용량의 데이터를 분산 처리 시스템 없이 처리할 수 있는 data.table 데이터 구조와 이를 조작, 관리하는데 사용하는 data.table 패키지에 대해서 소개합니다.
2022/02/11
Yujin Lee

Docker와 Traefik을 활용한 Reverse-Proxy 구현

docker
lecture

Docker와 Traefik을 활용한 Reverse-Proxy 구현
2022/02/08
SiYeol Jung

tableone 패키지 소개

R
Rpackage

효율적으로 의학 연구 논문에 들어갈 table1을 만들 수 있는 tableone 패키지에 대해 소개합니다.
2022/02/07
Yujin Lee

gtsummary 패키지 소개

R
Rpackage

데이터 셋의 변수를 하나의 테이블로 요약하여 효율적으로 논문에 들어갈 table1을 만들 수 있는 gtsummary 패키지에 대해 소개합니다.
2022/02/04
Yujin Lee

창업 경험 공유

presentation
lecture

성균관의대 “의사의 길” 학부 강의에서 창업 경험을 의대생들과 공유할 예정입니다. 발표 슬라이드를 미리 공유합니다.
2022/01/25
Jinseob Kim

인턴십 - DB 자동 백업을 위한 Docker 및 Github 활용

docker
github

MySQL 기반 DockerContainer에서 GitHub-Repository로의 주기적인 DB 백업 구현
2022/01/20
Siyeol Jung

인턴십 - Django로 게시판 만들고 기능 추가하기

Django

숭실대학교 인턴십 프로그램을 통해 인턴으로 활동하게 된 차라투에서 1주차 동안 학습한 내용에 대해 공유합니다.
2022/01/05
Siyeol Jung

Notion으로 홈페이지 제작후 oopy로 배포한 후기

review

Notion과 Oopy를 사용해 개편한 당사 홈페이지의 구축 논의 사항과 장·단점을 설명하였습니다.
2021/10/01
Changwoo Lim

Shiny 환자데이터 입력웹 개발(2)

presentation
shiny

4월에 이어 삼성서울병원 심혈관중재실에 서비스중인 shiny 환자데이터 입력웹을 소개합니다. 본 내용은 차라투가 후원하는 Shinykorea 10월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2021/09/28
Jinseob Kim

Google Login

review

Zarathu 앱에 적용할 예정인 구글 로그인에 대해 소개합니다.
2021/09/11
Lee Hyunki

R 활용 공공빅데이터 분석지원

presentation
R
shiny

R 활용 웹기반으로 공공빅데이터 분석지원한 경험을 공유합니다. 본 내용은 “대한상부위장관 · 헬리코박터학회 주관 2021 위원회 워크숍” 에서 발표할 예정입니다.
2021/08/21
Jinseob Kim

R 활용 의학연구지원

presentation
R
shiny

R 활용 의학연구지원경험을 공유합니다. 본 내용은 “Be a data scientist - major actor in the future research” 라는 제목으로 사단법인 헬리코박터 마이크로바이옴 연구회 워크숍에서 발표할 예정입니다.
2021/08/19
Jinseob Kim

googleAuth

lecture

Follow up assignment of ShinyProxy lecture
2021/07/25
HyunJun Ko

창업지원사업 도전기

presentation
kstartup

지금까지 창업지원사업 도전했던 경험을 공유합니다. 본 내용은 차라투가 후원하는 Shinykorea 7월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2021/07/11
Jinseob Kim

채널톡(channel.io) 설치 후기

review

최근 Zarathu 공식 홈페이지에 추가한 channel.io 서비스 관련 적용 후기입니다.
2021/07/05
Changwoo Lim

Shiny 환자데이터 입력웹 개발

presentation
shiny

삼성서울병원 심혈관중재실과 개발 중인 shiny 환자데이티 입력웹 개발 현황을 공유합니다. 본 내용은 Zarathu가 후원하는 Shinykorea 4월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2021/04/02
Jinseob Kim

코로나 수리모델링: 서울시 감염병연구센터 자문

presentation
R

서울시 감염병연구센터 자문으로 코로나 수리모델링을 수행한 경험을 정리했습니다. 본 내용은 2월 Shinykorea 밋업에서 발표할 예정입니다.
2021/01/22
Jinseob Kim

생존분석 실습

presentation
R
shiny
docker

Kaplan-meier curve, 비례위험가정 확인, Time-dependent analysis 그리고 모수적 생존분석을 중심으로 R 코드를 정리했습니다. 본 내용은 성균관의대 사회의학교실 특강에서 실습할 예정입니다.
2020/10/31
Jinseob Kim

의학통계지원 소개

presentation
R

차라투 업무 소개입니다. 본 내용은 영남대학교 “의사과학자 역량 배가 프로젝트” 에서 발표할 예정입니다.
2020/10/05
Jinseob Kim

RStudio & Shiny Docker 소개

presentation
R
shiny
docker

RStudio와 Shiny-server 가 포함된 Docker image 이용, 새로 서버 구축할 때마다 재설치하는 번거로움을 없앴습니다. 본 내용은 Shinykorea 10월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2020/10/05
Jinseob Kim

메타분석 웹 개발 후기

presentation
R
shiny

메타분석 ShinyApps 만든 후기를 정리하였습니다. 본 내용은 Shinykorea 8월 밋업에서 발표할 예정입니다..
2020/08/22
Jinseob Kim

회귀분석 in 의학연구

presentation
R

의학 연구에서 사용하는 선형/로지스틱 회귀분석과 Cox 비례위험모형을 소개합니다. 본 내용은 삼성서울병원 정신건강의학과 교육에 이용될 예정입니다.
2020/07/22
Jinseob Kim

의학 연구에서의 기술통계

presentation
R

의학 연구에서 Table 1 에 활용되는 기술통계를 정리하였습니다. 본 내용은 삼성서울병원 정신건강의학과 교육에 이용될 예정입니다.
2020/07/08
Jinseob Kim

2020년 만들었던 ShinyApps

presentation
shiny
R

올해 만들었던 ShinyApps 를 간단히 정리하였습니다. 본 내용은 6월 shinykorea 밋업에서 발표할 예정입니다.
2020/06/20
Jinseob Kim

R 데이터 매니지먼트 최근: tidyverse

presentation
lecture
R

%>% 연산자와 dplyr 패키지를 중심으로, 최근 R 문법 트렌드인 tidyverse 스타일을 정리했습니다. 본 슬라이드는 서울대병원 진단검사의학과 선생님들의 교육에 쓰일 예정입니다.
2020/04/14
Jinseob Kim

R 데이터 매니지먼트: 기초

presentation
lecture
R

R 기본 문법과, 보험공단 샘플 데이터를 이용한 데이터 매니지먼트 방법을 정리하였습니다. 본 내용은 서울대병원 진단검사의학과 선생님들의 교육에 쓰일 예정입니다.
2020/03/10
Jinseob Kim

TokyoR 81회 리뷰

presentation
lecture

일본 R 밋업 중 하나인 TokyoR 중 shiny 특집을 리뷰하였습니다. 본 내용은 차라투가 후원하는 Shinykorea 3월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2020/02/14
Jinseob Kim

R로 만드는 웹 애플리케이션

presentation
lecture
R
shiny

R과 shiny로 웹 애플리케이션을 만든 경험을 소개합니다. 본 내용은 디시인사이드가 후원하는 프로그래밍 갤러리 컨퍼런스 2020 에서 발표할 예정입니다.
2020/01/25
Jinseob Kim

RSelenium 이용 팁

presentation
lecture

RSelenium 으로 웹크롤링을 하면서 얻은 팁을 공유합니다. 본 내용은 Zarathu가 후원하는 Shinykorea 1월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2019/11/30
Jinseob Kim

의료 데이터분석가 성장기: 동국대학교 의생명공학과 세미나

presentation
lecture

의료데이터 분석가가 되기까지의 경험을 슬라이드로 공유합니다. 본 내용은 동국대학교 의생명공학과 세미나에서 발표할 예정으로, 초청해주신 김진식 교수님께 감사드립니다.
2019/11/04
Jinseob Kim

Shiny 워크샵: 서울IT직업전문학교 국비교육

presentation
lecture
shiny
R
workshop

Shiny 기초학습을 위한 강의 슬라이드와 실습파일입니다. 본 내용은 “서울IT직업전문학교 빅데이터 사이언스 실무자 양성과정” 에서 쓰일 예정입니다.
2019/10/27
Jinseob Kim

RUCK2019 발표: From ShinyApps to CRAN

presentation
Rpackage
R
shiny

맞춤형 의학연구 앱을 만들고, 그것을 패키지로 만들어 CRAN에 배포한 경험을 슬라이드로 정리하였습니다. 본 내용은 R User Conference in Korea 2019(RUCK 2019)에서 발표하였습니다.
2019/10/25
Jinseob Kim

R 이용 공공빅데이터 분석 경험

presentation
lecture
Rpackage
R

R을 이용, 공단/심평원 빅데이터와 국건영 자료를 분석한 경험을 슬라이드로 정리하였습니다. 본 내용은 을지의대 학술원 특강에서 발표할 예정입니다.
2019/09/20
Jinseob Kim

ShinyApps 에 로그인 기능 넣기

presentation
lecture
Rpackage
shiny
R
shinykorea

Shiny 의 로그인 기능 추가방법을 리뷰하고, useR! 2019 에서 소개된 shinymanager 패키지 사용법을 설명하였습니다. 본 내용은 Zarathu가 후원하는 Shinykorea 9월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2019/08/25
Jinseob Kim

선형모형의 다차원공간으로의 확장(2): 허수축 도입

article
statistics
R
Rpackage

이전 글 “선형모형의 다차원공간으로의 확장” 의 추가 제안으로, 선형모형의 무대를 허수축(Imaginary Axis)을 포함한 휘어진 다차원공간으로 확장, Inverted U-shape 관계를 선형관계로 재해석하였습니다.
2019/08/14
Jinseob Kim

괴델의 불완전성 정리

presentation
lecture
mathematics

괴델(Kurt Gödel)의 불완전성 정리가 나온 배경을 소개하고 증명의 핵심 아이디어를 수학과 메타수학(meta-mathematics), 괴델수(Gödel number), 그리고 메타수학의 수학화 3가지로 나누어 설명하였습니다. 본 내용은 “제주대학교 경영정보학과 산업·직무 특화 전문가 특강” 에서 발표할 예정입니다.
2019/05/22
Jinseob Kim

R 활용 맞춤형 통계지원 소개

presentation
lecture
Rpackage
shiny
R
shinykorea

의학연구를 지원하면서 다양하게 R을 활용했던 경험을 슬라이드로 정리하였습니다. 본 내용은 을지의과대학교 5월 EMBRI 세미나와 CRScube 6월 세미나에서 발표할 예정입니다.
2019/05/13
Jinseob Kim

Shiny 활용 의학연구지원 경험

presentation
lecture
Rpackage
shiny
R
shinykorea

Shiny와 R Markdown을 활용, 의학연구를 지원했던 경험을 슬라이드로 정리하였습니다. 본 내용은 차라투(주)가 후원하는 Shinykorea 5월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2019/05/11
Jinseob Kim

세무기장마법사 머니핀(MoneyPin) 리뷰

review
finance

법인 설립 후 세무기장 앱 머니핀(MoneyPin)을 활용, 직접 세무/회계를 처리하였습니다. 3월말 법인세까지 납부하면서 한 사이클을 경험했다고 생각하여 후기를 공유합니다.
2019/04/04
Jinseob Kim

ShinyApps를 R 패키지로 만들기

presentation
lecture
Rpackage
shiny
R
shinykorea

개인 PC에서 직접 ShinyApps를 이용할 수 있도록, RStudio Addins을 포함한 R 패키지를 만들어 CRAN에 배포신청했으나 실패한 경험을 정리하였습니다. 본 내용은 Anpanman이 후원하는 Shinykorea 2월 밋업에서 발표할 예정입니다.
2019/02/23
Jinseob Kim

Self-controlled case series

presentation
lecture
sccs

성균관의대 사회의학교실 주관 가습기 살균제 연구 세미나에 참석, 자기 자신을 대조군으로 이용하는 연구 방법론 중 하나인 self-controlled case series (SCCS)를 리뷰하고 R로 실습을 진행할 예정입니다. 강의 슬라이드를 미리 공유합니다.
2019/02/06
Jinseob Kim

R Markdown 기초

lecture
markdown

YAML Header, 마크다운(Markdown) 텍스트, R 코드 청크(chunk) 그리고 그림과 테이블을 중심으로, R 코드와 분석 결과가 포함된 문서를 작성하는 방법을 정리하였습니다.
2019/01/28
Jinseob Kim

R 데이터 매니지먼트: tidyverse

lecture
tidyverse
data.table
purrr
R

파일을 읽는 readr, 읽기 쉬운 코드를 만드는 %>% 연산자, 데이터를 다루는 dplyr 그리고 반복문을 다루는 purrr 패키지를 중심으로 tidyverse 생태계에서 데이터를 다루는 방법을 정리하였습니다.
2019/01/23
Jinseob Kim

진료실 밖 의사로서의 경험

presentation
lecture

성균관의대 “의사의 길” 학부 강의에서 진료실 밖 의사로서의 경험을 의대생들과 공유할 예정입니다. 발표 슬라이드를 미리 공유합니다.
2019/01/23
Jinseob Kim

의학 연구에서의 기술 통계 with R

lecture
statistics
R
shiny

중앙보훈병원 정신건강의학과에서 강의한 내용으로, 의학 연구에 필요한 기술 통계(descriptive statistics)를 정리하고 웹 애플리케이션과 Rstudio Addins을 이용하여 실습하였습니다.
2018/11/28
Jinseob Kim

New Scale Measure of Heritability in Binary Trait Using Median Odds Ratio: Median OR Ratio

article
statistics
R

유전율(heritability)은 어떤 형질의 유전적인 측면을 정량적으로 설명하는 유용한 지표이나 이분형 형질의 경우 해석이 어렵습니다. 이 때는 Sibling recurrence risk가 직관적인 지표이나, 유병률 정보가 필요하고 다른 변수의 보정이 어려운 문제가 있습니다. 본 연구에서는 흔히 쓰는 OR scale을 이용, 이분형 변수에서 직관적이고 다른 변수의 보정도 가능한 유전율 지표를 제안합니다.
2018/11/08
Jinseob Kim

선형모형의 다차원공간으로의 확장 (Linear Model in Multidimensional Space)

article
statistics
R
Rpackage

아인슈타인의 일반상대성이론은 태양 근처에서 빛이 휘어지는 현상을 빛이 아닌 시공간이 휘어지는 것으로 해석합니다. 비슷한 아이디어를 통계학에 적용하여 U-shape 관계를 휘어진 다차원 공간에서의 선형모형으로 재해석하였습니다.
2018/11/08
Jinseob Kim

맞춤형 의학연구 애플리케이션을 위한 개발 환경 구축

presentation
lecture
devOps
R
docker
shiny

R User Conference in Korea 2018(RUCK 2018)에서 발표했던 내용입니다.
2018/11/08
Jinseob Kim

Redefine Null Hypothesis

article
statistics
R

P value의 가장 큰 문제는 샘플 숫자만 늘리면 아무리 작은 차이라도 유의미한 결과로 만들 수 있다는 것입니다. 이는 대부분의 연구에서 차이가 정확히 0이라는 비현실적인 귀무가설을 사용하기 때문에 생기는 문제인데, 실제 차이가 정확히 0이라고 생각하는 사람은 아무도 없으며 아무도 주장하지 않는 것을 반박해 봐야 유용한 결론을 얻지 못합니다. 본 연구에서는 귀무가설에 uncertainty 개념을 추가하여 가설검정방법을 재정의하였습니다.
2018/11/08
Jinseob Kim

Welcome

radix

Welcome to Anpanman!
2018/09/25
Jinseob Kim
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