차라투 블로그

R과 통계의 이야기들.

By Zarathu

Latest Insights

Breslow 방식을 이용한 Cox 예측 모델 만들기

Date: 2025-05-07

Breslow 방식을 이용해 baseline hazard를 구하는 법을 공부해봅시다.

FDA의 RCT Guidance for industry

Date: 2025-04-18

FDA에서 발표한 RCT에서 공변량 보정 가이드라인을 공부해봅니다.

ADaM Compliant ADSL Dataset Generation

Date: 2025-04-08

Step-by-step guide for creating CDISC ADaM-compliant ADSL datasets using R.

Comparison of Models for Competing Risk Analysis

Date: 2025-04-07

Competing risk model의 C-index, AUC, Brier score를 계산하고 비교하는 R 코드 소개

Sankey Diagram 텍스트 삽입

Date: 03-26-2025

R로 생성한 Sankey plot에 JavaScript를 활용해 텍스트를 추가하는 방법을 알아보고, 이를 자동화한 Shiny App을 소개합니다.

Breslow 방식을 이용한 Cox 예측 모델 만들기

statistics

Breslow 방식을 이용해 baseline hazard를 구하는 법을 공부해봅시다.

FDA의 RCT Guidance for industry

presentation

FDA에서 발표한 RCT에서 공변량 보정 가이드라인을 공부해봅니다.

ADaM Compliant ADSL Dataset Generation

R

Step-by-step guide for creating CDISC ADaM-compliant ADSL datasets using R.

Comparison of Models for Competing Risk Analysis

R

Competing risk model의 C-index, AUC, Brier score를 계산하고 비교하는 R 코드 소개

Sankey Diagram 텍스트 삽입

shiny

R로 생성한 Sankey plot에 JavaScript를 활용해 텍스트를 추가하는 방법을 알아보고, 이를 자동화한 Shiny App을 소개합니다.

Intraclass Correlation Coefficient 공부하기

statistics

Intraclass Correlation Coefficient에 대해 정리하였습니다.

Kappa 분석 이해하기

statistics

여러 종류의 Kappa 분석 방법을 설명하고, R 코드 예제를 통해 실전에서 활용하는 방법을 정리하였습니다.

quarto 의 기초

R

YAML Header, 마크다운(Markdown) 텍스트, R 코드 청크(chunk) 그리고 그림과 테이블을 중심으로, R 코드와 분석 결과가 포함된 문서를 작성하는 방법을 정리하였습니다.

Exploring Regression Models for Regression Analysis (1): Regression Analysis, Linear Regression, HC Standard Errors

statistics

Regression Analysis의 기본 Model인 Linear regression과 이의 robust한 (Co)variance Matrix Estimator인 HC Standard Errors(HCCCM), Wild Bootstrap에 대해서 공부합니다.

Exploring Regression Models for Regression Analysis (2): GLM, Exponential Family, Link Function, IRLS(Fisher scoring), Cluster-robust standard error

statistics

종속변수가 Non-Normal한 Data에서 Regression Analysis를 수행하기 위해 종속변수의 분포 조건을 Exponential Family로 확장하고 Link Function로 근사하는 Regression Model인 GLM의 수학적 원리에 대해서 공부합니다. 또, clustered data 버전의 robust 표준오차(Cluster-robust standard error)에 대해서 살펴봅니다.

Exploring Regression Models for Regression Analysis (3): GEE, GLMM, M-statistics, Robust (sandwich) estimation

statistics

Data가 Independent하지 않고 Clustered되어 있을 때 Regression Analysis를 수행하기 위해 GLM에서 발전된 두 가지 모델 GEE와 GLMM의 개념을 공부하고, M-estimator와 Robust (sandwich) estimation을 통해 지금까지의 Robust한 Covariance Matrix을 generalize하게 살펴봅니다.

Sample Size Estimation in MRMC

R

RJafroc Package를 통해 Multi-Reader Multi-Case(이하 MRMC) 연구에서 표본 크기를 추정하는 방법에 대해 알아보자.

Standardized Mean Difference

statistics

Effect size 중 하나인 Standardized Mean Difference의 개념을 살펴보고, SMD를 활용해 baseline covariate의 balance 평가를 해보자.

Competing Risk Analysis

statistics

Competing Risk Analysis의 원리와 결과가 가지는 의미를 살펴봅니다

Multi-Reader Multi-Case Analysis

statistics

MRMC(Multi-Reader Multi-Case) 분석을 이해하고, iMRMC package를 통해 예시를 살펴본다.

data.table의 rolling join

R

data.table에서 제공하는 inequality join method 중 하나인 rolling merge에 대해 알아보자

tidyplots: 간편한 그래프 작성 라이브러리

R

tidyplots 패키지를 이용하여 주어진 데이터로 빠르게 그래프를 그려보자

DeLong’s Method; for ROC AUC

statistics

ROC AUC와 관련된 통계; SE 추정과 이의 CI 구하기.

collapse 패키지 소개 v2

R

collapse; fast, flexible, parsimonoius code package for R.

RWD를 이용한 RCT 모방 : Target Trial Emulation by Clone-Censor-Weight method

statistics

Clone-Censor-Weight method를 이용한 Target trial emulation을 소개하고, 실습해 봅니다.